Hinspiele am Samstag, 15.09.2012.
Rückspiele am 19.09.
Metalurg Donezk : FC Brasov
RCD Mallorca : Valerenga Oslo
Inter Baku : FC Zürich
FC Le Mans : AEK Athen
Anzhi Makhachkala : Levadia Tallin
FK Sarajevo : Krylya Sovetov Samara
Sporting Braga : Derry City
Udinese Calcio : SK Rapid Wien
SK Brann Bergen : Kayserispor
Rosenborg Trondheim : Dinamo Minsk
PSV Eindhoven : IFK Göteborg
CS Marítimo Funchal : SK Sturm Graz
Amkar Perm : HJK Helsinki
AC Florenz : Lech Posen
FK Krasnodar : Grasshopper Club Zürich
Deportivo La Coruna : FC Litex Lovetch
FC Inter Turku : FC Slovan Liberec
Benfica Lissabon : FC Midtjylland
RC Lens : Tromsö IL
Karpaty Lviv : FK Teplice
FK Ventspils : CD Nacional Funchal
Hapoel Tel Aviv : Vorskla Poltava
Gaziantepspor : Maccabi Haifa
Dinamo Moskau : IF Elfsborg Boras
Arsenal Kiew : Aris Thessaloniki
Twente Enschede : Otelul Galati
FC Vaslui : RNK Split
West Ham United : Anorthosis Famagusta
AFC Sunderland : FK Baku
VVV-Venlo : Omonia Nikosia
Sivasspor : Odense Boldklub
HB Torshavn : KAA Gent
HNK Rijeka : Rapid Bukarest
Helsingborg IF : Kuban Krasnodar
Slask Wroclaw : SK Slovan Bratislava